De Deense Zeemanskerk in Rotterdam werd opgericht in 1954 met de aanstelling van de eerste pastoor. In de beginjaren woonde de Deense kerk in bij de Zweedse kerk op Parklaan 5.
In 1962 haalde Rotterdam New York in en werd de grootste haven van de wereld. Naar aanleiding van het 100 jaar jubileum in 1967 van de organisatie Deense Zeemanskerken in den vreemde (Dansk Somandskirke i Fremmede Havne) havde 100-ars jubilaeum i 1967, werd besloten een eigen kerk te bouwen in Rotterdam.
Store Bededag 1970 vond de inwijding van de nieuwe Zeemanskerk plaats in het bijzijn van de Deense koning Frederik de 9de en de Nederlandse koningin Juliana en Prins Bernhard.
De kerk wordt 40 jaar later steeds meer gebruikt.